Narodowa Infrastruktura Superkomputerowa dla EuroHPC - EuroHPC PL

Identyfikator grantu: PT00962

Kierownik projektu: Jerzy Proficz

Realizatorzy:

  • Krzysztof Ocetkiewicz
  • Cezary Czaplewski
  • Agnieszka Lipska
  • Adam Liwo
  • Adam Sieradzan
  • Paweł Czarnul

Politechnika Gdańska, CI TASK

Gdańsk

Data otwarcia: 2022-04-06

Streszczenie projektu

Przedsięwzięcie ma na celu realizację badań naukowych poprzez budowę i udostępnienie polskiej nauce zasobów superkomputerowych umożliwiających przeprowadzanie obliczeń wielkiej skali, wpisujących się bezpośrednio w ramy międzynarodowej inicjatywy EuroHPC – European High-Performance Computing opublikowanej w komunikacie Komisji Europejskiej. Zadaniem CI TASK jest udział w budowie platformy obliczeniowej poprzez udoskonalenie pakietu oprogramowania do symulacji biomolekularnej: UNRES.

Publikacje

  1. Ocetkiewicz, K., Czaplewski, C., Krawczyk, H., Lipska, A., Liwo, J., Proficz, J., Sieradzan, A., & Czarnul, P., UNRES-GPU for Physics-Based Coarse-Grained Simulations of Protein Systems at Biological Time- and Size-Scales, BIOINFORMATICS 39, (2023) 391
  2. Sieradzan, A., Sans‐duñó, J., Lubecka, E., Czaplewski, C., Lipska, A., Leszczyński, H., Ocetkiewicz, K., Proficz, J., Czarnul, P., Krawczyk, H., & Liwo, A., Optimization of parallel implementation of UNRES package for coarse‐grained simulations to treat large proteins, JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY 44, (2023) 602-625
  3. Lipska, A., Sieradzan, A., Czaplewski, C., Lipińska, A. D., Ocetkiewicz, K., Proficz, J., Czarnul, P., Krawczyk, H., & Liwo, A., Long‐time scale simulations of virus‐like particles from three human‐norovirus strains, JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY 44, (2023) 1470-1483


← Powrót do spisu projektów

KONTAKT

Nasi konsultanci służą pomocą przyszłym i początkującym użytkownikom specjalistycznego oprogramowania zainstalowanego na Komputerach Dużej Mocy w Centrum Informatycznym TASK.

Kontakt w sprawach Komputerów Dużej Mocy, oprogramowania/licencji, grantów obliczeniowych, sprawozdań:

kdm@task.gda.pl

Administratorzy odpowiadają na maile w dni robocze w godzinach 8:00 – 15:00.