Badania in silico białek błonowych oraz ich oddziaływania z innymi biomolekułami o potencjale

Białka błonowe są kluczowym elementem procesu transdukcji sygnału do wnętrza komórki, a zaburzenie ich działania prowadzi do nieprawidłowego funkcjonowania komórek i licznych schorzeń. Badania będą obejmowały modelowanie struktury oraz oddziaływań białko-ligand lub białko-białko dla wybranych białek błonowych: receptorów sprzężonych z białkiem G (GPCR), białek transportowych oraz białek wirusowych. Wszystkie badane białka pełnią istotne role fizjologiczne i są, bądź mogą być, punktem docelowym działania leków. Symulacje będą obejmowały dynamikę molekularną kompleksów białko-ligand oraz białko-białko w błonie lipidowej, a także procesy oligomeryzacji GPCR. Wyniki przeprowadzonych symulacji umożliwią racjonalne projektowanie nowych substancji leczniczych działających poprzez badane białka.