Szukanie nowych repelentów komarów

Kierownik projektu: Karolina Mikulska-Rumińska

Realizatorzy:

  • Beata Niklas

Uniwersytet Mikołaja Kopernika

Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej

Toruń

Data otwarcia: 2018-11-29

Streszczenie projektu

Komary to dla człowieka jedne z najbardziej niebezpiecznych zwierząt. Roznoszą choroby, a przy tym są w stanie wykryć obecność człowieka już z odległości 50 metrów. Jednakże węch, którym się posługują by zlokalizować ofiarę można "zablokować" niektórymi związkami chemicznymi. W niniejszym projekcie wykorzystujemy wiedzę eksperymentalną dostarczoną przez naszych współpracowników w celu wytypowania i zweryfikowania nowych związków chemicznych, które będą wpływały na receptory węchu komara [1]. W ramach projektu przeprowadzone zostaną obliczenia klasycznej dynamiki molekularnej (MD) w programie NAMD i Gromacs uwzględniające receptor GPCR wraz z błoną oraz odpowiednio wytypowanymi repelentami. Symulacje MD białka z różnymi ligandami pozwolą zweryfikować model uzyskany drogą dokowania jak również określić miejsca ortosteryczne i allosteryczne.

1. Abd-Ella, A.; Stankiewicz, M.; Mikulska, K.; Nowak, W.; Pennetier, C.; Goulu, M.; Fruchart-Gaillard, C.; Licznar, P.; Apaire-Marchais, V.; List, O., The Repellent DEET Potentiates Carbamate Effects via Insect Muscarinic Receptor Interactions: An Alternative Strategy to Control Insect Vector-Borne Diseases. PloS one 2015, 10, e0126406.


Publikacje

  1. B. Niklas, K. Mikulska-Ruminska, B. Lapied, W. Nowak, Neurotoxic agonists and antagonists docking to M1 GPCR, EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS tom 48, (2019) S195-S195
  2. Beata Niklas, Milena Jankowska, Dalia Gordon, László Béress, Maria Stankiewicz, Wiesław Nowak, Interactions of Sea Anemone Toxins with Insect Sodium Channel—Insights from Electrophysiology and Molecular Docking Studies, Molecules (Multidisciplinary Digital Publishing Institute, MDPI) 26(5) , (2021) 1302-1324


← Powrót do spisu projektów

KONTAKT

Nasi konsultanci służą pomocą przyszłym i początkującym użytkownikom specjalistycznego oprogramowania zainstalowanego na Komputerach Dużej Mocy w Centrum Informatycznym TASK.

Kontakt w sprawach Komputerów Dużej Mocy, oprogramowania/licencji, grantów obliczeniowych, sprawozdań:

kdm@task.gda.pl

Administratorzy odpowiadają na maile w dni robocze w godzinach 8:00 – 15:00.