Grant/Projekt zakończony
Badanie wpływu modyfikacji cukrami na oddziaływanie i dynamikę układów biologicznie czynnych
Identyfikator grantu: PT00673
Kierownik projektu: Rafał Ślusarz
Uniwersytet Gdański
Wydział Chemii
Gdańsk
Data otwarcia: 2018-05-09
Data zakończenia: 2023-05-25
Streszczenie projektu
W ramach projektu prowadzone są badania w jaki sposób układy o znanej lub spodziewanej aktywności biologicznej zmieniają naturę wzajemnego oddziaływania, jak podstawienia jednostkami cukrowymi zmieniają dynamikę układów, skupiska ich preferowanych rodzin oraz ogólne powinowactwo do otoczenia. Badane są zarówno układy działające z użyciem mechanizmów receptorowych, jak i ogólnego wiązania na powierzchniach lub w centrach aktywnych biomolekuł.
Głównymi technikami badawczymi są dynamika molekularna, analiza konformacyjna i skupień, statystyka zależności energii od konformacji i oddziaływań.
Strona projektu: http://rslusarz.strony.ug.edu.pl/TASK/
Publikacje
- J. Samaszko-Fiertek, B. Dmochowska, R. Ślusarz, J. Madaj, The oxolane ring opening of some muramic acid derivatives under acidic conditions, Letters in Organic Chemistry 15, iss. 8, (2018) 693-697
- B. Dmochowska, L. Pellowska-Januszek, J. Samaszko-Fiertek, R. Ślusarz, R. Wakieć, J. Madaj, Efficient synthesis and antifungal investigation of nucleosides' quaternaryammonium salt derivatives, Turkish Journal of Chemistry 43, (2019) 157-171
- J. Samaszko-Fiertek, M. Szulc, B. Dmochowska, M. Jaśkiewicz, W. Kamysz, R. Ślusarz, J. Madaj, Influence of carbohydrate residues on antibacterial activity of vancomycin, Letters in Organic Chemistry 17(4), (2020) 287-293
- B. Dmochowska, R. Ślusarz, J. Chojnacki, J. Samaszko-Fiertek, J. Madaj, The quaternization reaction of 5-O-sulfonates of methyl 2,3-O-isopropylidene-b-D-ribofuranoside with selected heterocyclic and aliphatic amines, Molecules 25(9), (2020) 2161-2173
- Anna Antoniak, Iga Biskupek, Krzysztof K. Bojarski, Cezary Czaplewski, Artur Giełdoń, Mateusz Kogut, Małgorzata M. Kogut, Paweł Krupa, Agnieszka G. Lipska, Adam Liwo, Emilia A. Lubecka, Mateusz Marcisz, Martyna Maszota-Zieleniak, Sergey A. Samsonov, Adam K. Sieradzan, Magdalena J. Ślusarz, Rafał Ślusarz, Patryk A. Wesołowski, Karolina Ziȩba, Modeling protein structures with the coarse-grained UNRES force field in the CASP14 experiment, Journal of Molecular Graphics and Modelling 108, (2021) 108008
- Rafał Ślusarz, Barbara Dmochowska, Justyna Samaszko-Fiertek, Krzysztof Brzozowski, Janusz Madaj, NMR and MD Analysis of the Bonding Interaction of Vancomycin with Muramyl Pentapeptide, Int J Mol Sci 9, (2022) 1071428
KONTAKT
Nasi konsultanci służą pomocą przyszłym i początkującym użytkownikom specjalistycznego oprogramowania zainstalowanego na Komputerach Dużej Mocy w Centrum Informatycznym TASK.
Kontakt w sprawach Komputerów Dużej Mocy, oprogramowania/licencji, grantów obliczeniowych, sprawozdań:
Administratorzy odpowiadają na maile w dni robocze w godzinach 8:00 – 15:00.