Szukanie nowych repelentów komarów

Kierownik projektu: Karolina Mikulska-Rumińska

Realizatorzy:

  • Beata Niklas

Uniwersytet Mikołaja Kopernika

Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej

Toruń

Data otwarcia: 2018-11-29

Streszczenie projektu

Komary to dla człowieka jedne z najbardziej niebezpiecznych zwierząt. Roznoszą choroby, a przy tym są w stanie wykryć obecność człowieka już z odległości 50 metrów. Jednakże węch, którym się posługują by zlokalizować ofiarę można "zablokować" niektórymi związkami chemicznymi. W niniejszym projekcie wykorzystujemy wiedzę eksperymentalną dostarczoną przez naszych współpracowników w celu wytypowania i zweryfikowania nowych związków chemicznych, które będą wpływały na receptory węchu komara [1]. W ramach projektu przeprowadzone zostaną obliczenia klasycznej dynamiki molekularnej (MD) w programie NAMD i Gromacs uwzględniające receptor GPCR wraz z błoną oraz odpowiednio wytypowanymi repelentami. Symulacje MD białka z różnymi ligandami pozwolą zweryfikować model uzyskany drogą dokowania jak również określić miejsca ortosteryczne i allosteryczne.

1. Abd-Ella, A.; Stankiewicz, M.; Mikulska, K.; Nowak, W.; Pennetier, C.; Goulu, M.; Fruchart-Gaillard, C.; Licznar, P.; Apaire-Marchais, V.; List, O., The Repellent DEET Potentiates Carbamate Effects via Insect Muscarinic Receptor Interactions: An Alternative Strategy to Control Insect Vector-Borne Diseases. PloS one 2015, 10, e0126406.


Publikacje

  1. B. Niklas, K. Mikulska-Ruminska, B. Lapied, W. Nowak, Neurotoxic agonists and antagonists docking to M1 GPCR, EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS tom 48, (2019) S195-S195


← Powrót do spisu projektów

CONTACT

Our consultants help future and novice users of specialized software installed on High Performance Computers (KDM) at the TASK IT Center.

Contact for High Performance Computers, software / licenses, computing grants, reports:

kdm@task.gda.pl

Administrators reply to e-mails on working days between 8:00 am – 3:00 pm.