Grant/Projek zakończony

Szukanie nowych repelentów komarów

Identyfikator grantu: PT00703

Kierownik projektu: Karolina Mikulska-Rumińska

Uniwersytet Mikołaja Kopernika

Wydział Fizyki, Astronomii i Informatyki Stosowanej

Toruń

Data otwarcia: 2018-11-29

Data zakończenia: 2024-02-20

Streszczenie projektu

Komary to dla człowieka jedne z najbardziej niebezpiecznych zwierząt. Roznoszą choroby, a przy tym są w stanie wykryć obecność człowieka już z odległości 50 metrów. Jednakże węch, którym się posługują by zlokalizować ofiarę można "zablokować" niektórymi związkami chemicznymi. W niniejszym projekcie wykorzystujemy wiedzę eksperymentalną dostarczoną przez naszych współpracowników w celu wytypowania i zweryfikowania nowych związków chemicznych, które będą wpływały na receptory węchu komara [1]. W ramach projektu przeprowadzone zostaną obliczenia klasycznej dynamiki molekularnej (MD) w programie NAMD i Gromacs uwzględniające receptor GPCR wraz z błoną oraz odpowiednio wytypowanymi repelentami. Symulacje MD białka z różnymi ligandami pozwolą zweryfikować model uzyskany drogą dokowania jak również określić miejsca ortosteryczne i allosteryczne.

1. Abd-Ella, A.; Stankiewicz, M.; Mikulska, K.; Nowak, W.; Pennetier, C.; Goulu, M.; Fruchart-Gaillard, C.; Licznar, P.; Apaire-Marchais, V.; List, O., The Repellent DEET Potentiates Carbamate Effects via Insect Muscarinic Receptor Interactions: An Alternative Strategy to Control Insect Vector-Borne Diseases. PloS one 2015, 10, e0126406.


Publikacje

  1. B. Niklas, K. Mikulska-Ruminska, B. Lapied, W. Nowak, Neurotoxic agonists and antagonists docking to M1 GPCR, EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS tom 48, (2019) S195-S195
  2. Beata Niklas, Milena Jankowska, Dalia Gordon, László Béress, Maria Stankiewicz, Wiesław Nowak, Interactions of Sea Anemone Toxins with Insect Sodium Channel—Insights from Electrophysiology and Molecular Docking Studies, Molecules (Multidisciplinary Digital Publishing Institute, MDPI) 26(5) , (2021) 1302-1324
  3. Beata Niklas, Bruno Lapied, Wieslaw Nowak, In Search of Synergistic Insect Repellents: Modeling of Muscarinic GPCR Interactions with Classical and Bitopic Photoactive Ligands, Molecules 27(10), (2022) 3280-3303
  4. Beata Niklas, Szukanie nowych repelentów komarów, International Journal of Molecular Sciences 24 (12), (2023) 10334-10350
  5. Beata Niklas, Neurotoxic ligands interactions with insects membrane proteins, Nicolaus Copernicus University in Torun -, (2023) 108 stron


← Powrót do spisu projektów

CONTACT

Our consultants help future and novice users of specialized software installed on High Performance Computers (KDM) at the TASK IT Center.

Contact for High Performance Computers, software / licenses, computing grants, reports:

kdm@task.gda.pl

Administrators reply to e-mails on working days between 8:00 am – 3:00 pm.