Analiza danych z sekwencjonowania NGS genów ssaków z rodzaju

Analiza danych z sekwencjonowania NGS genów ssaków z rodzaju Canis wykonywana będzie dla celów dwóch projektów badawczych finansowanych przez NCN. Pierwszy z nich dotyczy analizy genów odpowiedzialnych za cechy różnicujące psy domowe od wilków i innych dzikich psowatych, które mogą być konsekwencją tzw. „syndromu udomowienia”. Drugi projekt dotyczy genów pod wpływem introgresji adaptacyjnej w wyniku hybrydyzacji między psami domowymi a wilkami oraz szakalami złocistymi. Zbiory tych genów częściowo się pokrywają, dlatego są one analizowane wspólnie. Analiza bioinformatyczna surowych danych z sekwencjonowania NGS będzie polegała na odtworzeniu sekwencji poszczególnych genów przez porównanie danych z genomem referencyjnym psa domowego oraz na analizie zmienności wewnątrz- i międzygatunkowej każdego z genów.