Badanie słabych oddziaływań międzycząsteczkowych w roztworach i kryształach
Identyfikator grantu: PT01008
Kierownik projektu: Piotr Bruździak
Realizatorzy:
- Aneta Panuszko
- Bartosz Cieśla
- Przemysław Pastwa
- Maciej Ejnik
- Kinga Cader
- Julia Godlewska
- Jacek Gajewski
Politechnika Gdańska
Wydział Chemiczny
Gdańsk
Data otwarcia: 2022-11-17
Planowana data zakończenia grantu: 2025-11-17
Streszczenie projektu
Celem głównym projektu jest uzyskanie informacji na poziomie molekularnym o charakterze i energii oddziaływań międzycząsteczkowych w roztworach oraz kryształach. Badania dotyczące roztworów, zwłaszcza wodnych, są prowadzone w Katedrze Chemii Fizycznej Wydziału Chemicznego Politechniki Gdańskiej od wielu lat. W niniejszym projekcie będą one ukierunkowane głównie na poszukiwanie molekularnych przyczyn wpływu specyficznych związków organicznych oraz metaloorganicznych na strukturę rozpuszczalnika oraz na proste modele bardziej złożonych białek i peptydów. W badaniach wykorzystane zostaną obliczenia DFT układów wieloskładnikowych, które pozwolą na uzyskanie informacji o kierunkowości i energii oddziaływań. Analiza gęstości elektronowych, będących ubocznym produktem każdych obliczeń kwantowo-mechanicznych, za pomocą metody NCI pozwoli zwizualizować i scharakteryzować słabe oddziaływania w układach. Obliczenia tego typu, wspomagane analizą QTAIM, pozwolą określić nie tylko charakter oddziaływań, ale również wskazać jaką rolę odgrywa rozpuszczalnik. Obliczenia teoretyczne zostaną skonfrontowane z wynikami eksperymentalnymi, aby zwiększyć ich wiarygodność oraz zaproponować mechanizmy zachodzących w układach procesów, których nie można wprost zweryfikować za pomocą stosowanych technik eksperymentalnych (przede wszystkim spektroskopia IR, krystalografia rentgenowska, kalorymetria). Symulowane widma IR pozwolą także na przypisanie pasm obserwowanych na widmach, a także interpretację zmian na widmach eksperymentalnych w układach wieloskładnikowych.
Publikacje
- Kowalkowska-Zedler D., Bruździak P., Hnatejko Z., Łyszczek R., Brillowska-Dąbrowska A., Ponikiewski Ł., Cieśla B., Pladzyk A., Solvent influence on the crystal structures of new cadmium tri-tert-butoxysilanethiolate complexes with 1,4-bis(3-aminopropyl)piperazine: luminescence and antifungal activity, Molecular and Biomolecular Spectroscopy 79, (2023) 305
- Maciej Ejnik, Piotr Bruździak, Anna Ciborska, Anna Dołęga, Aktywność katalityczna kompleksów złota(III) w reakcji hydrolizy 2-cyjanopirydyny. Badania eksperymentalne i teoretyczne, XIX Ogólnopolskie Seminarium Doktorantów i Studentów, "Na pograniczu chemii i biologii", Trzebieszowice -, (2023) -
- Aneta Panuszko,Przemysław Pastwa, Jacek Gajewski, Piotr Bruździak, Characterizing Interactions Between Small Peptides and Dimethyl Sulfoxide Using Infrared Spectroscopy and Computational Methods, Molecules 29, (2024) 5869
- Cieśla Bartosz, Projektowanie i synteza nowych układów luminescencyjnych na bazie silanotiolanowych kompleksów cynku i kadmu z użyciem pochodnych pirazyny, dyplom magisterski, Politechnika Gdańska, Wydział Chemiczny -, (2024) -
- Pastwa Przemysław, Badanie oddziaływań w wodnych roztworach DMSO, diglicyny oraz 2-acetamido-N-metyloacetamidu za pomocą obliczeń kwantowo-mechanicznych, dyplom inżynierski, Politechnika Gdańska, Wydział Chemiczny -, (2024) -
- Cader Kinga, Badania obliczeniowe DFT oddziaływań N-tlenku trimetyloaminy z mocznikiem lub kationem guanidynowym w roztworach wodnych, dyplom inżynierski, Politechnika Gdańska, Wydział Chemiczny -, (2024) -
- Ejnik Maciej, Badania obliczeniowe DFT oddziaływań N-tlenku trimetyloaminy z mocznikiem lub kationem guanidynowym w roztworach wodnych, dyplom inżynierski, Politechnika Gdańska, Wydział Chemiczny -, (2024) -