CI TASK wraz z innymi ośrodkami KDM i MAN w kraju oraz ośrodkami zagranicznymi prowadzi projekty badawcze w zakresie rozwoju i wykorzystania Internetu dla potrzeb nauki, budowy środowisk typu Grid, szerokopasmowej transmisji danych w sieciach krajowych i międzynarodowych. Centrum udziela również wsparcia wybranym projektom rozwoju i promocji wolnego oprogramowania związanym z systemem operacyjnym Linux.

Projekty realizowane i utrzymywane w CI TASK:

• CD NIWA: Centrum Doskonałości Naukowej Infrastruktury Wytwarzania Aplikacji (lata 2013-2015)
• KRICO: Komponent Rekomendacji Inteligentnych Chmur Obliczeniowych (lata 2014-2017)
• MAN-HA - Realizacja w MAN-ach usług krytycznych o wysokim poziomie niezawodności (lata 2013-2015)
• "MAYDAY EURO 2012" Superkomputerowa platforma kontekstowej analizy strumieni danych multimedialnych do identyfikacji wyspecyfikowanych obiektów lub niebezpiecznych zdarzeń - KASKADA (lata 2008-2012)
  
• NewMAN - Rozbudowa 21 środowiskowych sieci teleinformatycznych nauki (lata 2009-2012)
• Platforma Obsługi Nauki PLATON - Kontener usług wspólnych (lata 2008-2012)
• PLATON U1 - Usługi wideokonferencji
• PLATON U2 - Usługi eduroam
• PLATON U3 - Usługi kampusowe
• PLATON U4 - Usługi powszechnej archiwizacji 
• PLATON U5 - Usługi naukowej interaktywnej telewizji HD
• PL-Grid - Polska Infrastruktura Informatycznego Wspomagania Nauki w Europejskiej Przestrzeni Badawczej (lata 2009-2012)
• PL-Grid Plus - Dziedzinowo zorientowane usługi i zasoby infrastruktury PL-Grid dla wspomagania Polskiej Nauki w Europejskiej Przestrzeni Badawczej (lata 2011-2014)
• PLGrid NG - Dziedzinowe Usługi Nowej Generacji w Infrastrukturze PL-Grid dla Polskiej Nauki (lata 2014-2015)
• Pomorska Biblioteka Cyfrowa
• PRACE -  Partnership for Advanced Computing in Europe

Projekty realizowane przez użytkowników KDM:

Użytkownicy CI TASK realizują rocznie około 80 projektów naukowych z wykorzystaniem zasobów CI TASK (Komputery Dużej Mocy, oprogramowanie). Ich lista znajduje się w sekcji KDM >> Projekty użytkowników.

Projekty zakończone, nieutrzymywane:

• cdlinux.pl (do 2007 r.)
• Clusterix - Krajowy Klaster Linuksowy (lata 2003-2006) 
• Krajowy Magazyn Danych (lata 2008-2010)
• Krajowy Magazyn Danych 2 (lata 2011-2013)
• SGI Grid (lata 2002-2005)
• TAGO: Trójmiejski Akademicki Grid Obliczeniowy
• VoIP
• ZSPDO: Zintegrowany System Przetwarzania Danych Oceanograficznych (lata 2008-2012)