Logowanie do System sprawozdań KDM

Rozwój liniowo skalujących się podejść QM/MM dla polaryzowalnych pól siłowych

Kierownik projektu: Jacek Dziedzic

Politechnika Gdańska

Wydział Fizyki Technicznej i Matematyki Stosowanej

Katedra Fizyki Ciała Stałego

Gdańsk

Streszczenie projektu

Projekt realizowany jest w ramach grantu EP/K039156/1 "SI2-CHE: Development and Deployment of Chemical Software for Advanced Potential Energy Surfaces". Obszar zainteresowania projektu obejmuje kwantowo-klasyczne techniki hybrydowe (QM/MM), gdzie podsystem kwantowy opisywany jest teorią funkcjonału gęstości w liniowo skalującym się ujęciu macierzy gęstości (linear-scaling density-matrix density functional theory, LS-DFT), a podsystem klasyczny - przy użyciu polaryzowalnego pola siłowego typu AMOEBA.

Celem projektu jest opracowanie fizycznie spójnego i możliwie dokładnego wzajemnego sprzężenia elektrostatyczno-polaryzacyjnego podsystemów kwantowego i klasycznego. Sprzężenie tego rodzaju pozwala na wzajemną polaryzację podsystemów, umożliwiając osadzanie obliczeń kwantowych w środowisku stanowionym przez punktowe, centrowane atomowo multipole i vice versa. Docelowo rozwijane sprzężenie ma uwzględniać również oddziaływania wzajemne nie mające natury elektrostatycznej (dyspersyjne, wymiany, przeniesienia ładunku). Badania prowadzone są w kontekście liniowo skalujących się metod DFT wykorzystujących nieortogonalne bazy orbitali optymalizowanych in situ.

Publikacje

  1. Dziedzic J, Mao Y, Shao Y, Ponder J, Head-Gordon T, Head-Gordon M, Skylaris CK, TINKTEP: A fully self-consistent, mutually polarizable QM/MM approach based on the AMOEBA force field., Journal of Chemical Physics 145(12), (2016) 124106
  2. Alex Albaugh, Henry A. Boateng, Richard T Bradshaw, Omar N. Demerdash, Jacek Dziedzic, Yuezhi Mao, Daniel Toby Margul, Jason M Swails, Qiao Zeng, David A. Case, Peter Kenneth Eastman, Jonathan W. Essex, Martin Head-Gordon, Vijay S. Pande, Jay William Ponder, Yihan Shao, Chris-Kriton Skylaris, Ilian T. Todorov, Mark Edward Tuckerman, and Teresa Head-Gordon, Advanced Potential Energy Surfaces for Molecular Simulation, J. Phys. Chem. B 120, (2016) 9811-9832

Centrum Informatyczne Trójmiejskiej Akademickiej Sieci Komputerowej
ul. G. Narutowicza 11/12, 80-233 Gdańsk   |   tel. 58-347-24-11
email: office@task.gda.pl   |   NIP: 584-020-35-93